https://wikicshse.ru/index.php?action=history&feed=atom&title=%D0%9A%D0%BB%D0%B0%D1%81%D1%82%D0%B5%D1%80%D0%B8%D0%B7%D0%B0%D1%86%D0%B8%D1%8F_%D1%80%D0%B0%D0%BA%D0%BE%D0%B2%D1%8B%D1%85_%D1%82%D1%80%D0%B0%D0%BD%D1%81%D0%BA%D1%80%D0%B8%D0%BF%D1%82%D0%BE%D0%B2_%28%D0%BF%D1%80%D0%BE%D0%B5%D0%BA%D1%82%29 2026-06-06T18:17:38Z История изменений этой страницы в вики MediaWiki 1.45.3 https://wikicshse.ru/index.php?title=%D0%9A%D0%BB%D0%B0%D1%81%D1%82%D0%B5%D1%80%D0%B8%D0%B7%D0%B0%D1%86%D0%B8%D1%8F_%D1%80%D0%B0%D0%BA%D0%BE%D0%B2%D1%8B%D1%85_%D1%82%D1%80%D0%B0%D0%BD%D1%81%D0%BA%D1%80%D0%B8%D0%BF%D1%82%D0%BE%D0%B2_(%D0%BF%D1%80%D0%BE%D0%B5%D0%BA%D1%82)&diff=1169&oldid=prev 2015-10-20T07:43:27Z

<p>Migrated current public revision from wiki.cs.hse.ru</p> <p><b>Новая страница</b></p><div>{{Карточка_проекта<br /> |name=Кластеризация раковых транскриптов<br /> |mentor=Вита Степанова<br /> |mentor_login={{URLENCODE:Vita Stepanova|WIKI}}<br /> |semester=Весна 2015<br /> |course=1<br /> |summer=<br /> |categorize=yes<br /> |is_archived=yes<br /> }}<br /> <br /> === Что это за проект? ===<br /> Известно, что раковые опухоли могут характеризоваться различными степенями тяжести. В последнее время активно развиваются способы оценки степени тяжести опухоли по данным генной экспрессии. В рамках данного проекта студентам предлагается кластеризовать раковые транскрипты и сравнить свои кластеры с морфологическими наблюдениями.<br /> <br /> === Чему вы научитесь? ===<br /> * Основы молекулярной биологии<br /> * Обработка и интерпретация данных генной экспресии<br /> * Применение математических методов для решения медицинских задач<br /> <br /> === Какие начальные требования? ===<br /> Навыки программирования, интерес к изучению генетики и лечения рака<br /> <br /> === Какие будут использоваться технологии? ===<br /> Данные для исследования будут загружены из БД GEO. Опционально могут быть использованы программы по обработке сырых данных микрочипов.<br /> <br /> === Темы вводных занятий ===<br /> * Экспрессия генов и способы её оценки<br /> * Способы интерпретации данных микрочипов<br /> * Алгоритмы кластеризации<br /> <br /> === Направления развития ===<br /> Интересным продолжением задачи станет решение проблемы определения набора дифференциально экспрессированных генов, необходимого для эффективной кластеризации раковых транскриптов. Это позволит упростить молекулярно-биологический прогноз состояния и развития раковой опухоли при первичном обращении пациента в больницу.<br /> <br /> === Критерии оценки ===<br /> * 4-5: реализовать простейший алгоритм кластеризации данных экспрессии генов <br /> * 6-7: реализовать простейший алгоритм кластеризации данных экспрессии генов, соотнести результаты его работы с реальными наблюдениями для данного типа рака<br /> * 8-10: сравнить разные алгоритмы кластеризации, выбрать лучший на основе его сравнения с реальными наблюдениями</div>

imported>Ira dolgaleva